Scopri migliaia di nuovi batteri e virus: una pratica curativa

Ricerca: scoperta di nuovi ceppi di virus e batteri

Il virus SARS-CoV-2 e la malattia COVID-19 causata dal virus stanno tenendo il mondo intero in attesa. Tuttavia, molti altri agenti patogeni possono anche causare malattie infettive. Il mio gruppo di ricerca ha ora scoperto migliaia di nuovi ceppi di virus e batteri.

Secondo un altro Messaggio Uno studio congiunto sul microbioma condotto dall’Istituto di genetica medica e genomica applicata presso l’ospedale universitario di Tubinga e la Weill Cornell Graduate School di New York ha scoperto migliaia di nuovi batteri e virus in tutto il mondo. Ricercando questi campioni, i ricercatori appartenenti al Consorzio Internazionale MetaSUB possono identificare i ceppi resistenti agli antibiotici e sviluppare nuovi farmaci.

Campioni da stazioni della metropolitana e ospedali

Durante lo studio triennale, gli scienziati dell’International Metagonomics and Metadesign of Subways and Urban Biomes (MetaSUB) hanno scoperto 10.928 virus e 748 ceppi batterici che non erano ancora stati registrati in alcun database di riferimento.

Il team di ricerca guidato da Daniela Bezdan (University Hospital Tübingen) e David Dinko (Weill Cornell Graduate School di New York) ha raccolto più di 5.000 campioni da stazioni della metropolitana densamente popolate, stazioni ferroviarie e ospedali in 60 città in 32 paesi diversi per il prossimo -seguenziamento della generazione. , Che è un metodo per il sequenziamento del DNA.

Con l’aiuto dei campioni di microbi che sono stati studiati, i cosiddetti microbi, gli esperti sperano di saperne di più sui batteri, virus e altri microrganismi che vivono negli esseri umani.

“Sebbene siano necessarie ulteriori ricerche, questi dati dimostrano il valore e il potenziale della mappatura e del monitoraggio del microbioma e le informazioni che può fornire a medici, scienziati e funzionari della sanità pubblica”, spiega Daniela Bezdan.

I risultati dello studio sono stati recentemente pubblicati sulla rivista.cellula“Pubblicato. Una pubblicazione supplementare è apparsa sulla rivista specializzata.”Microbioma“.

Una speciale miscela cittadina di batteri rari

Secondo il comunicato, i campioni hanno ampiamente rivelato un mix specifico della città di specie batteriche rare che costituiscono un microbioma unico che ha consentito ai ricercatori di prevedere dove vive una persona con una precisione fino al 90%, semplicemente sequenziando il DNA sulle scarpe.

Si scopre che molti fattori influenzano il microbioma di una città, tra cui la popolazione totale, la densità di popolazione, l’altitudine, la vicinanza al mare e il clima. La conoscenza scientifica di queste diverse firme potrebbe consentire futuri studi forensi.

“Il microbioma contiene una risonanza molecolare del luogo in cui è stato raccolto. Un campione costiero può contenere microbi amanti del sale, mentre un campione di una città densamente popolata può mostrare una biodiversità sorprendente”. Danco.

Identificazione di ceppi resistenti agli antibiotici

Secondo i ricercatori, queste nuove scoperte potrebbero aiutare a identificare i ceppi resistenti agli antibiotici.

Prevedere la resistenza agli antibiotici dalla sola sequenza genetica è difficile, ma gli scienziati sono stati in grado di identificare alcuni dei geni associati alla resistenza, determinarne la frequenza e confermare la loro capacità di trasmettere resistenza.

È stato scoperto che alcune città hanno più geni di resistenza di altre e quindi ci sono firme specifiche per città per alcuni di questi geni.

Poiché molti degli antibiotici e dei farmaci attualmente in uso derivano da fonti batteriche, la ricerca sulle molecole e le proteine ​​prodotte dai microbi dovrebbe aiutare a scoprire più nuove molecole e antibiotici. Secondo gli esperti, oltre agli strumenti e agli approcci di laboratorio, questi farmaci potrebbero contribuire allo sviluppo di nuovi farmaci.

I virus come SARS-CoV-2 non possono essere rilevati utilizzando i metodi di analisi del DNA di questo studio. “In studi futuri, esamineremo sia il DNA che l’RNA in modo da poter rilevare virus a RNA come SARS-CoV-2 negli ambienti urbani in più di 50 paesi in tutto il mondo”, spiega Daniela Bezdan. (Anno Domini)